获奖名称：“中国最佳服务创新企业”奖 获奖机构：华大集团 颁发机构：国际管理咨询公司科尔尼、中欧国际商学院以及《商业周刊/中文版》

获奖名称：2013年全球最具创新力技术企业50强 获奖机构：华大集团 颁发机构：麻省理工《科技创业》杂志

获奖项目：第一个亚洲人基因组 获奖类别：2012年度广东省科学技术奖二等奖 获奖机构：深圳华大生命科学研究院(原“深圳华大基因研究院”) 颁发机构：广东省人民政府

获奖名称：基因组短序列寡核苷酸分析方法与系统获2012年中国产学研合作创新成果奖 获奖机构：华大生命科学研究院(原“华大基因研究院”) 颁发机构：中国产学研合作促进会

获奖名称：广东省科技服务业百强机构 获奖机构：华大集团 颁发机构：广东省科学技术厅

获奖名称：中国科学院防治非典工作先进基层党组织 获奖机构：华大集团（原“华大基因”） 颁发机构：中共中国科学院党组